| Ident. | Authors (with country if any) | Title |
|---|
| 000265 (2020) |
Megan L. Matthews [États-Unis] ; Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Ronald Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Cranos M. Williams [États-Unis] | Modeling cross-regulatory influences on monolignol transcripts and proteins under single and combinatorial gene knockdowns in Populus trichocarpa. |
| 000635 (2019) |
Min-Ha Kim [Corée du Sud] ; Jin-Seong Cho [Corée du Sud] ; Hyung-Woo Jeon [Corée du Sud, Australie] ; Kanidta Sangsawang [Corée du Sud] ; Donghwan Shim [Corée du Sud] ; Young-Im Choi [Corée du Sud] ; Eung-Jun Park [Corée du Sud] ; Hyoshin Lee [Corée du Sud] ; Jae-Heung Ko [Corée du Sud] | Wood Transcriptome Profiling Identifies Critical Pathway Genes of Secondary Wall Biosynthesis and Novel Regulators for Vascular Cambium Development in Populus. |
| 000748 (2019) |
Yongyao Fu [République populaire de Chine] ; Papa Win [République populaire de Chine] ; Huijuan Zhang [République populaire de Chine] ; Chaofeng Li [République populaire de Chine] ; Yun Shen [République populaire de Chine] ; Fu He [République populaire de Chine] ; Keming Luo [République populaire de Chine] | PtrARF2.1 Is Involved in Regulation of Leaf Development and Lignin Biosynthesis in Poplar Trees. |
| 000784 (2019) |
Jinshan Gui [République populaire de Chine] ; Laifu Luo [République populaire de Chine] ; Yu Zhong [République populaire de Chine] ; Jiayan Sun [République populaire de Chine] ; Toshiaki Umezawa [Japon] ; Laigeng Li [République populaire de Chine] | Phosphorylation of LTF1, an MYB Transcription Factor in Populus, Acts as a Sensory Switch Regulating Lignin Biosynthesis in Wood Cells. |
| 000798 (2019) |
Yongil Yang [États-Unis] ; Chang Geun Yoo [États-Unis] ; William Rottmann [États-Unis] ; Kimberly A. Winkeler [États-Unis] ; Cassandra M. Collins [États-Unis] ; Lee E. Gunter [États-Unis] ; Sara S. Jawdy [États-Unis] ; Xiaohan Yang [États-Unis] ; Yunqiao Pu [États-Unis] ; Arthur J. Ragauskas [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] ; Jin-Gui Chen [États-Unis] | PdWND3A, a wood-associated NAC domain-containing protein, affects lignin biosynthesis and composition in Populus. |
| 000872 (2019) |
Yunpeng Cao [République populaire de Chine] ; Xiaoxu Li [République populaire de Chine] ; Lan Jiang [République populaire de Chine] | Integrative Analysis of the Core Fruit Lignification Toolbox in Pear Reveals Targets for Fruit Quality Bioengineering. |
| 000923 (2019) |
Wan-Long Su [République populaire de Chine] ; Na Liu [République populaire de Chine] ; Li Mei [République populaire de Chine] ; Jie Luo [République populaire de Chine] ; Yi-Jie Zhu [République populaire de Chine] ; Zhu Liang [République populaire de Chine] | Global Transcriptomic Profile Analysis of Genes Involved in Lignin Biosynthesis and Accumulation Induced by Boron Deficiency in Poplar Roots. |
| 000943 (2019) |
Mingyang Quan [République populaire de Chine] ; Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Liang Xiao [République populaire de Chine] ; Wenjie Lu [République populaire de Chine] ; Longxin Wang [République populaire de Chine] ; Jianbo Xie [République populaire de Chine] ; Yuepeng Song [République populaire de Chine] ; Baohua Xu [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Genetic architecture underlying the lignin biosynthesis pathway involves noncoding RNAs and transcription factors for growth and wood properties in Populus. |
| 000970 (2019) |
Fernando P. Guerra [États-Unis, Chili] ; Haktan Suren [États-Unis] ; Jason Holliday [États-Unis] ; James H. Richards [États-Unis] ; Oliver Fiehn [États-Unis] ; Randi Famula [États-Unis] ; Brian J. Stanton [États-Unis] ; Richard Shuren [États-Unis] ; Robert Sykes [États-Unis] ; Mark F. Davis [États-Unis] ; David B. Neale [États-Unis] | Exome resequencing and GWAS for growth, ecophysiology, and chemical and metabolomic composition of wood of Populus trichocarpa. |
| 000975 (2019) |
Annette V. Alber [France, Canada] ; Hugues Renault [France] ; Alexandra Basilio-Lopes [France] ; Jean-Etienne Bassard [France] ; Zhenhua Liu [France] ; Pascaline Ullmann [France] ; Agnès Lesot [France] ; Frédéric Bihel [France] ; Martine Schmitt [France] ; Danièle Werck-Reichhart [France] ; Jürgen Ehlting [Canada] | Evolution of coumaroyl conjugate 3-hydroxylases in land plants: lignin biosynthesis and defense. |
| 000988 (2019) |
Lin Zheng [République populaire de Chine] ; Yajuan Chen [République populaire de Chine] ; Dong Ding [République populaire de Chine] ; Ying Zhou [République populaire de Chine] ; Liping Ding [République populaire de Chine] ; Jianhua Wei [République populaire de Chine] ; Hongzhi Wang [République populaire de Chine] | Endoplasmic reticulum-localized UBC34 interaction with lignin repressors MYB221 and MYB156 regulates the transactivity of the transcription factors in Populus tomentosa. |
| 000A29 (2019) |
Eric M. Anderson [États-Unis] ; Michael L. Stone [États-Unis] ; Rui Katahira [États-Unis] ; Michelle Reed [États-Unis] ; Wellington Muchero [États-Unis] ; Kelsey J. Ramirez [États-Unis] ; Gregg T. Beckham [États-Unis] ; Yuriy Román-Leshkov [États-Unis] | Differences in S/G ratio in natural poplar variants do not predict catalytic depolymerization monomer yields. |
| 000E25 (2018) |
Jack P. Wang [République populaire de Chine, États-Unis] ; Megan L. Matthews [États-Unis] ; Cranos M. Williams [États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Chenmin Yang [États-Unis] ; Sermsawat Tunlaya-Anukit [États-Unis] ; Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Quanzi Li [République populaire de Chine] ; Jie Liu [États-Unis] ; Chien-Yuan Lin [États-Unis] ; Punith Naik [États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun [Taïwan] ; Philip L. Loziuk [États-Unis] ; Ting-Feng Yeh [Taïwan] ; Hoon Kim [États-Unis] ; Erica Gjersing [États-Unis] ; Todd Shollenberger [États-Unis] ; Christopher M. Shuford [États-Unis] ; Jina Song [États-Unis] ; Zachary Miller [États-Unis] ; Yung-Yun Huang [États-Unis] ; Charles W. Edmunds [États-Unis] ; Baoguang Liu [République populaire de Chine] ; Yi Sun [République populaire de Chine] ; Ying-Chung Jimmy Lin [République populaire de Chine, États-Unis, Taïwan] ; Wei Li [République populaire de Chine, États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ilona Peszlen [États-Unis] ; Joel J. Ducoste [États-Unis] ; John Ralph [États-Unis] ; Hou-Min Chang [États-Unis] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; Mark F. Davis [États-Unis] ; Chris Smith [États-Unis] ; Fikret Isik [États-Unis] ; Ronald Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [République populaire de Chine, États-Unis] | Improving wood properties for wood utilization through multi-omics integration in lignin biosynthesis. |
| 001045 (2018) |
Punith Naik [États-Unis] ; Jack P. Wang [États-Unis] ; Ronald Sederoff [États-Unis] ; Vincent Chiang [États-Unis] ; Cranos Williams [États-Unis] ; Joel J. Ducoste [États-Unis] | Assessing the impact of the 4CL enzyme complex on the robustness of monolignol biosynthesis using metabolic pathway analysis. |
| 001231 (2017) |
Li Yang [République populaire de Chine] ; Xin Zhao [République populaire de Chine] ; Lingyu Ran [République populaire de Chine] ; Chaofeng Li [République populaire de Chine] ; Di Fan [République populaire de Chine] ; Keming Luo [République populaire de Chine] | PtoMYB156 is involved in negative regulation of phenylpropanoid metabolism and secondary cell wall biosynthesis during wood formation in poplar. |
| 001698 (2016) |
Li Yang [République populaire de Chine] ; Xin Zhao [République populaire de Chine] ; Fan Yang [République populaire de Chine] ; Di Fan [République populaire de Chine] ; Yuanzhong Jiang [République populaire de Chine] ; Keming Luo [République populaire de Chine] | PtrWRKY19, a novel WRKY transcription factor, contributes to the regulation of pith secondary wall formation in Populus trichocarpa. |
| 001873 (2016) |
Li Shuai [Suisse] ; Masoud Talebi Amiri [Suisse] ; Ydna M. Questell-Santiago [Suisse] ; Florent Héroguel [Suisse] ; Yanding Li [États-Unis] ; Hoon Kim [États-Unis] ; Richard Meilan [États-Unis] ; Clint Chapple [États-Unis] ; John Ralph [États-Unis] ; Jeremy S. Luterbacher [Suisse] | Formaldehyde stabilization facilitates lignin monomer production during biomass depolymerization. |
| 001A91 (2015) |
Jinhui Chen [République populaire de Chine] ; Beibei Chen [République populaire de Chine] ; Deqiang Zhang [République populaire de Chine] | Transcript profiling of Populus tomentosa genes in normal, tension, and opposite wood by RNA-seq. |
| 001B74 (2015) |
Chaofeng Li ; Xianqiang Wang ; Lingyu Ran [République populaire de Chine] ; Qiaoyan Tian [République populaire de Chine] ; Di Fan [République populaire de Chine] ; Keming Luo [République populaire de Chine] | PtoMYB92 is a Transcriptional Activator of the Lignin Biosynthetic Pathway During Secondary Cell Wall Formation in Populus tomentosa. |
| 001C02 (2015) |
Jack P. Wang [États-Unis] ; Ling Chuang [États-Unis] ; Philip L. Loziuk [États-Unis] ; Hao Chen [États-Unis] ; Ying-Chung Lin [États-Unis] ; Rui Shi [États-Unis] ; Guan-Zheng Qu [République populaire de Chine] ; David C. Muddiman [États-Unis] ; Ronald R. Sederoff [États-Unis] ; Vincent L. Chiang [États-Unis] | Phosphorylation is an on/off switch for 5-hydroxyconiferaldehyde O-methyltransferase activity in poplar monolignol biosynthesis. |
| 001C10 (2015) |
Zhigang Wei [République populaire de Chine] ; Zanshuang Qu [République populaire de Chine] ; Lijie Zhang [République populaire de Chine] ; Shuanjing Zhao [République populaire de Chine] ; Zhihong Bi [République populaire de Chine] ; Xiaohui Ji [République populaire de Chine] ; Xiaowen Wang [République populaire de Chine] ; Hairong Wei [États-Unis] | Overexpression of poplar xylem sucrose synthase in tobacco leads to a thickened cell wall and increased height. |
| 001C37 (2015) |
Manika Awasthi [Inde] ; Nivedita Jaiswal ; Swati Singh ; Veda P. Pandey ; Upendra N. Dwivedi | Molecular docking and dynamics simulation analyses unraveling the differential enzymatic catalysis by plant and fungal laccases with respect to lignin biosynthesis and degradation. |
| 001D15 (2015) |
Wellington Muchero [États-Unis] ; Jianjun Guo [États-Unis] ; Stephen P. Difazio [États-Unis] ; Jin-Gui Chen [États-Unis] ; Priya Ranjan [États-Unis] ; Gancho T. Slavov [Royaume-Uni] ; Lee E. Gunter [États-Unis] ; Sara Jawdy [États-Unis] ; Anthony C. Bryan [États-Unis] ; Robert Sykes [États-Unis] ; Angela Ziebell [États-Unis] ; Jaroslav Klápšt [Canada, République tchèque] ; Ilga Porth [Canada] ; Oleksandr Skyba [Canada] ; Faride Unda [Canada] ; Yousry A. El-Kassaby [Canada] ; Carl J. Douglas [Canada] ; Shawn D. Mansfield [Canada] ; Joel Martin [États-Unis] ; Wendy Schackwitz [États-Unis] ; Luke M. Evans [États-Unis] ; Olaf Czarnecki [États-Unis] ; Gerald A. Tuskan [États-Unis] | High-resolution genetic mapping of allelic variants associated with cell wall chemistry in Populus. |
| 002029 (2014) |
Hsi-Chuan Chen [République populaire de Chine] ; Jina Song ; Jack P. Wang ; Ying-Chung Lin ; Joel Ducoste ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; Quanzi Li ; Rui Shi ; Angelito Nepomuceno ; Fikret Isik ; David C. Muddiman ; Cranos Williams ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Systems biology of lignin biosynthesis in Populus trichocarpa: heteromeric 4-coumaric acid:coenzyme A ligase protein complex formation, regulation, and numerical modeling. |
| 002518 (2013) |
Jun Shigeto [Japon] ; Yuko Kiyonaga ; Koki Fujita ; Ryuichiro Kondo ; Yuji Tsutsumi | Putative cationic cell-wall-bound peroxidase homologues in Arabidopsis, AtPrx2, AtPrx25, and AtPrx71, are involved in lignification. |
| 002540 (2013) |
Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Wei Pan ; Baohua Xu ; Bailian Li ; Deqiang Zhang | Polymorphic simple sequence repeat (SSR) loci within cellulose synthase (PtoCesA) genes are associated with growth and wood properties in Populus tomentosa. |
| 002579 (2013) |
Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Jina Song ; Cranos M. Williams ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; Jack P. Wang ; Quanzi Li ; Rui Shi ; Emine Gokce ; Joel Ducoste ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Monolignol pathway 4-coumaric acid:coenzyme A ligases in Populus trichocarpa: novel specificity, metabolic regulation, and simulation of coenzyme A ligation fluxes. |
| 002584 (2013) |
Jonggeun Kim [Corée du Sud] ; Bosung Choi ; Young-Hwan Park ; Byoung-Kwan Cho ; Hyoun-Sub Lim ; Savithiry Natarajan ; Sang-Un Park ; Hanhong Bae | Molecular characterization of ferulate 5-hydroxylase gene from kenaf (Hibiscus cannabinus L.). |
| 002683 (2013) |
Qiaoyan Tian [République populaire de Chine] ; Xianqiang Wang ; Chaofeng Li ; Wanxiang Lu ; Li Yang ; Yuanzhong Jiang ; Keming Luo | Functional characterization of the poplar R2R3-MYB transcription factor PtoMYB216 involved in the regulation of lignin biosynthesis during wood formation. |
| 002725 (2013) |
Lara Danielsen [Allemagne] ; Gertrud Lohaus ; Anke Sirrenberg ; Petr Karlovsky ; Catherine Bastien ; Gilles Pilate ; Andrea Polle | Ectomycorrhizal colonization and diversity in relation to tree biomass and nutrition in a plantation of transgenic poplars with modified lignin biosynthesis. |
| 002779 (2013) |
Jennifer Lockhart | Breaking down the complex regulatory web underlying lignin biosynthesis. |
| 002787 (2013) |
Fernando P. Guerra [États-Unis] ; Jill L. Wegrzyn ; Robert Sykes ; Mark F. Davis ; Brian J. Stanton ; David B. Neale | Association genetics of chemical wood properties in black poplar (Populus nigra). |
| 002803 (2013) |
Qingzhang Du [République populaire de Chine] ; Baohua Xu ; Wei Pan ; Chenrui Gong ; Qingshi Wang ; Jiaxing Tian ; Bailian Li ; Deqiang Zhang | Allelic variation in a cellulose synthase gene (PtoCesA4) associated with growth and wood properties in Populus tomentosa. |
| 002977 (2012) |
Yan-Wen Wang [République populaire de Chine] ; Wen-Chao Wang ; Shang-Hui Jin ; Jun Wang ; Bo Wang ; Bing-Kai Hou | Over-expression of a putative poplar glycosyltransferase gene, PtGT1, in tobacco increases lignin content and causes early flowering. |
| 002A75 (2012) |
Jack P. Wang [États-Unis] ; Christopher M. Shuford ; Quanzi Li ; Jina Song ; Ying-Chung Lin ; Ying-Hsuan Sun ; Hsi-Chuan Chen ; Cranos M. Williams ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Functional redundancy of the two 5-hydroxylases in monolignol biosynthesis of Populus trichocarpa: LC-MS/MS based protein quantification and metabolic flux analysis. |
| 002C20 (2012) |
Jie Liu [États-Unis] ; Rui Shi ; Quanzi Li ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | A standard reaction condition and a single HPLC separation system are sufficient for estimation of monolignol biosynthetic pathway enzyme activities. |
| 002D96 (2011) |
Hsi-Chuan Chen [États-Unis] ; Quanzi Li ; Christopher M. Shuford ; Jie Liu ; David C. Muddiman ; Ronald R. Sederoff ; Vincent L. Chiang | Membrane protein complexes catalyze both 4- and 3-hydroxylation of cinnamic acid derivatives in monolignol biosynthesis. |
| 002E10 (2011) |
Fabio Marroni [Italie] ; Sara Pinosio ; Eleonora Di Centa ; Irena Jurman ; Wout Boerjan ; Nicoletta Felice ; Federica Cattonaro ; Michele Morgante | Large-scale detection of rare variants via pooled multiplexed next-generation sequencing: towards next-generation Ecotilling. |
| 002F51 (2011) |
Abdelali Barakat [Corée du Sud] ; Norzawani Buang M. Yassin ; Joseph S. Park ; Alex Choi ; Josh Herr ; John E. Carlson | Comparative and phylogenomic analyses of cinnamoyl-CoA reductase and cinnamoyl-CoA-reductase-like gene family in land plants. |
| 003069 (2010) |
Rui Shi [États-Unis] ; Ying-Hsuan Sun ; Quanzi Li ; Steffen Heber ; Ronald Sederoff ; Vincent L. Chiang | Towards a systems approach for lignin biosynthesis in Populus trichocarpa: transcript abundance and specificity of the monolignol biosynthetic genes. |
| 003195 (2010) |
Yun Lee [États-Unis] ; Eberhard O. Voit | Mathematical modeling of monolignol biosynthesis in Populus xylem. |
| 003284 (2010) |
Sylvain Legay [France] ; Pierre Sivadon ; Anne-Sophie Blervacq ; Nathalie Pavy ; Ahmad Baghdady ; Laurence Tremblay ; Caroline Levasseur ; Nathalie Ladouce ; Catherine Lapierre ; Armand Séguin ; Simon Hawkins ; John Mackay ; Jacqueline Grima-Pettenati | EgMYB1, an R2R3 MYB transcription factor from eucalyptus negatively regulates secondary cell wall formation in Arabidopsis and poplar. |
| 003356 (2010) |
Kurt V. Fagerstedt [Finlande] ; Eija M. Kukkola ; Ville V T. Koistinen ; Junko Takahashi ; Kaisa Marjamaa | Cell wall lignin is polymerised by class III secretable plant peroxidases in Norway spruce. |
| 003367 (2010) |
Jill L. Wegrzyn [États-Unis] ; Andrew J. Eckert ; Minyoung Choi ; Jennifer M. Lee ; Brian J. Stanton ; Robert Sykes ; Mark F. Davis ; Chung-Jui Tsai ; David B. Neale | Association genetics of traits controlling lignin and cellulose biosynthesis in black cottonwood (Populus trichocarpa, Salicaceae) secondary xylem. |
| 003450 (2009) |
Ruiqin Zhong [États-Unis] ; Zheng-Hua Ye | Transcriptional regulation of lignin biosynthesis. |
| 003534 (2009) |
Suvi Sutela [Finlande] ; Karoliina Niemi ; Jaanika Edesi ; Tapio Laakso ; Pekka Saranp ; Jaana Vuosku ; Riina M Kel ; Heidi Tiimonen ; Vincent L. Chiang ; Janne Koskim Ki ; Marja Suorsa ; Riitta Julkunen-Tiitto ; Hely H Ggman | Phenolic compounds in ectomycorrhizal interaction of lignin modified silver birch. |
| 003584 (2009) |
Max Bylesjö [Suède] ; Robert Nilsson ; Vaibhav Srivastava ; Andreas Grönlund ; Annika I. Johansson ; Steffan Jansson ; Jan Karlsson ; Thomas Moritz ; Gunnar Wingsle ; Johan Trygg | Integrated analysis of transcript, protein and metabolite data to study lignin biosynthesis in hybrid aspen. |
| 003593 (2009) |
Kanna Sato [Japon] ; Nobuyuki Nishikubo ; Yoko Mashino ; Kaori Yoshitomi ; Jinmei Zhou ; Shinya Kajita ; Yoshihiro Katayama | Immunohistochemical localization of enzymes that catalyze the long sequential pathways of lignin biosynthesis during differentiation of secondary xylem tissues of hybrid aspen (Populus sieboldii x Populus grandidentata). |
| 003680 (2009) |
Zhanyou Xu [États-Unis] ; Dandan Zhang ; Jun Hu ; Xin Zhou ; Xia Ye ; Kristen L. Reichel ; Nathan R. Stewart ; Ryan D. Syrenne ; Xiaohan Yang ; Peng Gao ; Weibing Shi ; Crissa Doeppke ; Robert W. Sykes ; Jason N. Burris ; Joseph J. Bozell ; Max Zong-Ming Cheng ; Douglas G. Hayes ; Nicole Labbe ; Mark Davis ; C Neal Stewart ; Joshua S. Yuan | Comparative genome analysis of lignin biosynthesis gene families across the plant kingdom. |
| 003A95 (2007) |
Jessica E. Hancock [États-Unis] ; Wendy M. Loya ; Christian P. Giardina ; Laigeng Li ; Vincent L. Chiang ; Kurt S. Pregitzer | Plant growth, biomass partitioning and soil carbon formation in response to altered lignin biosynthesis in Populus tremuloides. |
| 003C66 (2006) |
M. Christiernin [Suède] | Lignin composition in cambial tissues of poplar. |
